А какой метод учета себестоимости используете?
Соглашусь с Fordewind и apanko - как минимум странно анализировать только остатки на конец периода, выпадают быстрооборачиваемые товары.
Но светлым головам аналитиков виднее

Думаю наиболее простой путь для решения задачи - допилить функционал распределения товарных издержек в документах покупки:
1. Собрать остатки по операциям на дату
2. Из остатков сформировать строки распределения (код можно подсмотреть в ф-циях "Получить строки.....").
Другой вопрос в разрезе каких аналитик будет анализироваться добавочная себестоимость, если только по товару - то возможно и прокатит Ваш вариант с распределением на остатки.