Странно, но обычно проблема управленческого учета состояла в объединении информации (например из нескольких фирм), получение разных закономерностей, построение прогнозов, выявление причин затрат и т.д.
А вы тут про черные флаги разговариваете, про двойную сами знаете что...
))
ну да ладно....
В этом случае, дублировать план счетов не обязательно, можно его слегка расширить,
добавить настройку для видимости только избранным. Таблицы настройки просто дополнить новыми полями, в результате чего на те же группы учета можно будет повесить дополнительные операции, ну и естесственно немного переделать учет. Но это уже от специфики предприятия.
))
P.S. Ничем таким никогда не занимался и делать ничего не умею, поскольку противозаконно, это только лишь мои личные фантазии.