Для 4.00Sp1:
1. А если поиграть с General Ledger Setup - VAT Rounding Type:
own?
Только если это и сработает (я не уверен), то в другом случае вы, вдруг, захотите по-другому округлить и что тогда?
2. Никак. Было в 3.70 поле Calculate VAT per Lines в Sales & Receivables Setup, но сейчас функционал убит. В версии 5.00 быть может что-то и появится.