Мои пять копеек - (ItemId, DatePhysical, Qty), если забыть про фильтры по StatusReceipt и StatusIssue
Другие (не покрывающие) индексы при таком количестве данных (если мне память не изменяет, порядка 4 миллионов записей в InventTrans на дату) либо не будут использоваться, либо bookmark lookup-ы сделают доступ дороже table scan-а, что собственно и было продемонстрировано выше.
P.S. Забавное обсуждение, особенно если взглянуть на название ветки